Membranproteine

Minimale Probe, maximale Daten. Vereinfachen Sie Ihre Arbeit.
I'm Interested

Analysieren Sie Membranprotein-Interaktionen mit Leichtigkeit.

01

Keine Reinigung notwendig – Probenmaterial sparen

  • Nur 40 nl Probe pro Analyse
  • Direktarbeit in unaufgereinigten Proben (Zelllysat, Liquor, Plasma/Serum)
  • Keine Einschränkung der Pufferzusammensetzung
  • Einfache Probensicherung
  • Bis zu 10 Datenparameter pro Probe in einem Assay
  • Daten zur Optimierung der Expressionsbedingungen von Membranproteinen
  • Untersuchung der Membranproteinkinetik in Lösung
02

Interaktionsstudien direkt im Zelllysat

  • Screening in Minuten – beschleunigen Sie Ihren Workflow
  • Bindung basierend auf Molekülgröße und Fluoreszenz
  • Nachweis starker und schwacher Bindungen
  • Untersuchung der Membranproteinkinetik in Rohproben
03

Hohe Auflösung für Sicherheit und Reproduzierbarkeit

  • Breiter Bereich von pM bis mM
  • Autosampler beseitigt Pipettvariabilität und spart Zeit
  • Strukturelle & funktionale Ergebnisse aus einer einzigen Analyse
04

Kurze Assay-Optimierung und -Validierung

  • Spezielles Fidabio Assay Design Tool
  • Methoden nach ersten Prinzipien
  • Eingebaute QC beschleunigt den Optimierungsprozess
  • Absolute Messwerte und strukturelle Korrelation ermöglichen eine effiziente und zuverlässige Datenvalidierung
06

Kapillartechnologie ohne Verstopfung

  • Robuste Kapillarplattform ermöglicht kreative Biophysik
  • Funktioniert mit aggregiertem, unaufgereinigtem Material
  • Kein Verstopfen, keine Einschränkung der Pufferzusammensetzung
  • Aggregation jeder Probe wird gemessen und quantifiziert
07

Markiert oder label-frei

  • Flexible Tags: GFP, HIS, Alpha, FLAG u.ä.
  • Möglichkeit label-freier Charakterisierung gereinigter Membranproteine
08

Proben-QC bei jedem Lauf

  • Strukturelle Veränderungen bewerten
  • Validierung gegen Referenzmodelle mit dem FIDA PDB Correlator
  • Absolute Größenmessung
  • Polydispersitätsindex
  • Oligomerzustand
  • Aggregationsverhalten quantifiziert
  • Ligandenbindung & Kd-Quantifizierung
09

Temperaturkontrolle – Struktur & Funktion erhalten

  • Probe bei 5 °C im Walk-away-Modus gelagert
  • Unabhängige Temperaturkontrolle in Probe & Kapillarkompartiment

Effiziente Analyse und schnelle Entscheidungsfindung

Mit der Möglichkeit, Probenvolumina von nur 4 μL (typisch 10 μL) für den Analyten und 40 nL für den Indikator zu verwenden sowie direkt in unaufgereinigten Matrizes zu arbeiten, können FIDA-Nutzer deutlich mehr Datenpunkte in kürzerer Zeit gewinnen.

Die Nutzer platzieren unaufgereinigte Proben in die 96-Well-Platten oder 2×50 Vials des Autosamplers und können nach wenigen Stunden entscheiden, welches Membranprotein für weitere Analysen gereinigt werden soll.

Schnell und einfach – der FIDA-Weg.

Bis zu
4μL
Analyten
40nL
Indikator

Detergens-Screening für Solubilisierung – 85 % schneller

Save sample material

  • 10 to 100 times less sample volume in comparison to other technologies
  • 0.12 uL per detergent (for triplicates)
  • No restrictions on buffer compositions

Arbeiten mit jedem Detergens in beliebiger Konzentration

  • Kapillaren ohne Verstopfung
  • Zelllysat problemlos handhaben
  • Aggregation quantifizieren
  • Nachweisgrenze 50 nM (für GFP)

Absolute Größe und Fluoreszenz messen

  • Hohe Auflösung des hydrodynamischen Radius (0,5–500 nm)
  • BRIC – Binding Related Intensity Change
  • Zwei orthogonale Auswertungen aus einem Datensatz liefern ein vollständiges Bild

Durchführung einer Vorab-QC – in einem Lauf

  • Automatische QC vor Detailanalyse
  • Quantitative Bewertung der Aggregation
  • Bindungsstellenfunktionalität
  • Polydispersitätsindex bewertet die Gleichmäßigkeit der Solubilisierung
  • Früher Nachweis steigert die Effizienz, da ungeeignete Detergenzien eliminiert werden

Wie beschleunigt FIDA
das Detergens-Screeningfür die Protein-Solubilisierung?

FIDA-Nutzer verkürzen ihre Experimentzeit um 85 % und sparen Tage. Wie? Dank des autonomen Autosamplers von FIDA und der Möglichkeit, Probleme mit Stabilität, Oligomerzuständen und Bindungsstellenfunktion frühzeitig zu erkennen.

1.5 ul

singlets

<3h

Triplicates

Sample Volume

12 Detergents

Experimental Time

12 Detergents

Vorteile

Hält Zelllysat bei 5 °C im Walk-away-Modus
Quantitativer Nachweis von Aktivierung und Bindung in komplexen Membrankonstrukten
Geringerer Probenverbrauch
Schnelle Datengewinnung
Umfassende Qualitätskontrolle
Fundierte Fehlerbehebung

Merkmale

Dreifache Temperaturkontrolle
Autosampler
Quantifizierung von Aggregaten
Quantifizierung solubilisierter Membranproteine
Polydispersitätsindex
Oligomerisierung

Measures

Accurate determination of dilute phase concentration
Relative droplet size distributions
Kinetics of droplet formation and maturation into amyloid fibrils
Determination of binding affinity between the polypeptide undergoing LLPS and LLPS-modulating compounds

Gezielte Lösung häufiger Forschungsherausforderungen zu Membranproteinen

Challenge
Expression und Reinigung
FIDA-Nutzer können die Konzentration von Membranproteinen in Lösung bestimmen. Dadurch lassen sich Kristallisationsbedingungen optimieren und Prozesse von Expression & Reinigung überwachen.

Mit nur 0,12 µL pro Detergens (Triplikate) im Screening und bis zu 40 nL unaufgereinigter Probe für die Charakterisierung nutzt FIDA 10–100 Mal weniger Volumen als andere Technologien.
Stabilität und konformationelle Heterogenität
Dreifache Temperaturkontrolle und die Möglichkeit, in unaufgereinigten Matrizes zu arbeiten, erhöhen die Kontrolle über die Stabilität von Membranproteinen.
Funktionelle Charakterisierung
Arbeiten in Rohmatrizes erhöht die Anwendbarkeit der Ergebnisse. Der Polydispersitätsindex stellt sicher, dass die Probenheterogenität berücksichtigt wird.
Strukturelle Charakterisierung
Die von FIDA gelieferte Größenmessung ermöglicht es, Veränderungen durch Interaktionen mit Proteinen oder Liganden zu überwachen. Diese Informationen werden dann zur Analyse von Struktur und Funktion interessierender Membranproteine genutzt.

FIDA wird in der Cryo-EM-Probenpräparation sowie bei der Auswahl von Nanobody-Klonen eingesetzt. Nutzer können mit einer Technologie Membranproteine charakterisieren, Detergenzien screenen, Nanobodies zur Immobilisierung herstellen und Cryo-EM-Proben vorbereiten.
Effektive Arzneimittelentwicklung
FIDA misst die Größenänderung des Membranproteinkomplexes bei Ligandenbindung und ist damit ein optimales Werkzeug zur Bewertung von Protein-Ligand-Interaktionen. Diese Informationen helfen bei der Identifizierung potenzieller Liganden für die Arzneimittelentwicklung.

Learn more during an exploratory call with Fidabio team.

We are happy to answer all of your questions. Book an exploratory call to learn more about FIDA and the match between your personal needs and what we can deliver. The call is non-binding and free of any charges, so feel free to fill the form!

In comparison to SPR, it (FIDA) is a simple system that you can run without expertise. It does not require an experienced operator to run the system, due to its ease of use. A wide range of buffers can be used, meaning that optimization is kept to a minimum. The software generates an evaluation report of the quality parameters with just a click of a button. (...) We were able to confirm the performance by evaluating in-house compounds using the demo instrument on site.

Hiroshi Kamiyama, PhD
Eisai Co., Ltd. Tsukuba Research Laboratories

This methodology is very sensitive and useful for assessing binding in a quantitative manner using small amounts of auto-fluorescent proteins. Using this method, we can observe clear changes in apparent hydrodynamic radius (Rh) and in fluorescence signal of EYA1 as a function of increasing concentrations of peptides or of small molecules

Dana Farber Institute
CANCER INSTITUTE

''Fida  Instrument provides a ''ruler'' to measure the length of fibrils''

Stefan Rüdiger Ph.D.
Professor of Protein Chemistry of Disease; Head of Department of Chemistry

''The FIDA is very effective for screening small molecules for solubility and interactions with protein targets. A major advantage has been its ability to clearly show drug binding to difficult-to-work-with targets such as intrinsically disordered proteins and amyloids''

Dr. Alexander Taylor
Research Fellow in Biochemistry/Biophysics

I would say that this instrument is quite useful for core facilities at KI or for Swedish research community in general:

  1. it was possible to measure unlabeled membrane proteins and soluble proteins at low concentrations in small volumes very fast (~6 minutes per measurement).
  2. I also like the temperature control and the autosampler which allowed us to run a lot of samples overnight.
  3. I would say that there is a lot of potential to perform other assays as well, such as the Kd determinations etc. (For this, I use ITC which is quite time-consuming and requires a lot of protein).
  4. In addition, the software and user interface for sample runs and data analysis is quite straightforward and intuitive to use.
Postdoctoral Researcher

"What we value about FIDA is the amount of information we can get from a tiny amount of protein in a single QC run. FIDA technology enables us to understand our proteins better - particularly when they behave in unexpected ways. We chose FIDA because it gives us that vital first result quickly - we don't waste our time optimising an assay that isn't going to work."

Duncan Smith
Lead Scientist

"I am convinced. I have never before been able to detect the ternary construct formation of my construct directly in cell lysate – it took less than two hours."

Thomas Smith
Associate Director, Chemical Biology & Therapeutics

"The Fida 1’s unique capability for measuring binding Kd from weak mM level to strong pM level really enhances our bioanalytical capabilities."

Sherry Zhu
Senior Scientist

"FIDA is an in-solution technique, and thus an ideal binding assay for structurally diverse bsAbs because the analysis does not rely on potentially obstructive surface immobilization and hence it is able to perform characterizations that are unbiased by bsAb format and spatial orientation of the binding domains."

Andreas V. Madsen
PhD Student

"After thorough comparisons, it was clear that the Fida 1, amongst others, presents unique opportunities in analysis of membrane proteins, which is essential to us."

Svend Kjær
Deputy Head of the Structural Biology Science Technology Platform

''The Fida 1 system offers a new approach to detergent screening that has significant advantages allowing essential data to be obtained faster using less material (…) this work presents a new approach to characterize membrane proteins that allows users to reducing costs and time as well as to analyze protein expressed at low levels in a short time thus overcoming any stability issues.''

Isabel Moraes
Principal Research Scientist

"I like the ease of use and the straightforward data analysis and, that experiments can be performed in any type of buffers. We get data, where no other biophysical methods worked before."

Cathrine Birck
Head of Integrated Structural Biology Platform

"The method is easy to setup in any standard laboratory and can be adopted for a high throughput (HTTP) screening, which enabled mechanistic studies of RNA nuclease interactions, as well as efficient guide RNA lead discovery (…) Fida 1 offers straightforward assay development, walk away automation, absolute measurement and ultra low sample consumption."

Denny Truong
Principal Research Associate

"FIDA provides in-depth assessment of activity combined with local and global protein structural changes by measuring the overall hydrodynamic radius of the protein with minimal sample consumption. In addition, it is possible to measure the affinity constant for the analyzed interaction."

Dr. Melanie Hug
Research Associate

"The beauty of Fida 1 is that it allows us to conduct a lot of biophysical measurements in one system using a small amount of reagent and a rapid read-out time which is important for our projects and to our customers. (…) Providing a high-quality, protein characterisation QC package is certainly extending and future proofing our capabilities in biophysical characterisation of the proteins we produce."

Mark Abbott
Managing Director

"The Fida 1 has allowed us to assess the performance of MIPs with a much higher throughput than was previously possible on other platforms. MIPs can be developed in as little as 8 weeks, which is a significant improvement on antibodies, and now they can be fully characterized at an accelerated pace too."

Alan Thomson
CEO

"Fida 1 can be used for full characterization of ternary complex formation for targeted protein degradation. The Fida 1 platform only consumes 39 nL of sample for one measurement and thus allows elaborate condition screening using very small amounts of sample material."

Roman Agafonov
Associate Director of Biochemistry, Biophysics & Structural Biology

"The Fida1 is a very user-friendly system. With the Fida software we can quickly design new methods, set up experiments, and analyze data. By far this is a great instrument and technology that has allowed us to run binding assays for LNP in solution and with flexibility to run in any complex media which we were unable to do using traditional binding methods that required ligand immobilization. The FidaBio customer service is amazing, they are very knowledgeable and responsive whenever I run into issues and need assistance. I highly recommend this instrument for LNP or any other nanoparticle characterization. The system and technology are versatile with applications beyond nanoparticles and is a must in the biophysical tool kit."

Biophysical Analytical Department
Senior Scientist, Analytical Development

"Eventually, with FIDA, we managed to characterise our LNPs. And it was done in less than 2 days. We had for a long time been struggling with SPR."

Chemical Biology and Therapeutics
Associate Director

"We had been looking for ways of quantifying our exosomes, and tested many platform, without success. In less than 2 days FIDA had developed an assay and shown trustworthy quantifications directly in fermentation broth"

Rane Harrison
Director, Analytical Development