Protéines membranaires

Échantillon minimal, données maximales. Simplifiez votre travail.
I'm Interested

Analysez les interactions des protéines membranaires facilement.

01

Pas de purification nécessaire — préservez vos échantillons

  • Seulement 40 nl d’échantillon par analyse
  • Travaillez directement dans des échantillons non purifiés (lysat cellulaire, LCR, plasma/sérum)
  • Aucune contrainte de composition tampon
  • Récupération facile de l’échantillon
  • Jusqu’à 10 paramètres de données par échantillon dans un seul essai
  • Obtenez les données nécessaires pour optimiser l’expression des protéines membranaires
  • Étudiez la cinétique des protéines membranaires en solution
02

Études d’interaction directement dans le lysat cellulaire

  • Criblage en quelques minutes — accélérez votre flux de travail
  • Liaison basée sur la taille moléculaire et la fluorescence
  • Détection des liaisons fortes et faibles
  • Étudiez la cinétique des protéines membranaires dans des échantillons bruts
03

Haute résolution pour assurer fiabilité et reproductibilité

  • Plage étendue de pM à mM
  • L’autosampler élimine les variations de pipetage et gagne du temps
  • Données structurelles et fonctionnelles issues d’une seule analyse
04

Optimisation et validation rapide des essais

  • Outil dédié Fidabio Assay Design
  • Méthodes de premier principe
  • Le QC intégré accélère le processus d’optimisation
  • Les lectures absolues et la corrélation structurelle facilitent une validation des données efficace et fiable
06

Technologie capillaire sans colmatage

  • Plateforme capillaire robuste permettant des approches biophysiques créatives
  • Fonctionne avec du matériel agrégé, non purifié
  • Sans colmatage et sans contrainte de composition tampon
  • L’agrégation de chaque échantillon est mesurée et quantifiée
07

Marqué ou sans étiquette

  • Flexibilité des étiquettes : GFP, HIS, Alpha, FLAG, etc.
  • Possibilité de caractérisation sans étiquette des protéines membranaires purifiées
08

Contrôle qualité de l’échantillon à chaque analyse

  • Évaluer les changements structurels
  • Validation par rapport aux modèles de référence via l’outil FIDA PDB Correlator
  • Mesure de taille absolue
  • Indice de polydispersité
  • État oligomérique
  • Comportement d’agrégation quantifié
  • Détection de liaison ligand et quantification du Kd
09

Contrôle de température – préserver structure et fonction

  • Échantillon conservé à 5 °C en mode autonome
  • Contrôle de température indépendant dans échantillon et capillaire

Analyse efficace et prise de décision rapide

Avec la capacité d’utiliser des volumes d’échantillon aussi faibles que 4 μL (typiquement 10 μL) pour l’analyte et 40 nL pour l’indicateur, ainsi que la flexibilité de travailler directement dans des matrices non purifiées, les utilisateurs de FIDA peuvent obtenir un plus grand nombre de points de données dans un délai considérablement réduit.

Les utilisateurs placent des échantillons non purifiés dans les plaques 96 puits ou fioles 2×50 de l’autosampler, et après quelques heures ils peuvent choisir quelle protéine membranaire purifier pour une analyse ultérieure.

Rapide et simple – la voie FIDA.

Jusqu’à
4μL
analyte
40nL
indicateur

Criblage de détergents pour la solubilisation – 85 % plus rapide

Save sample material

  • 10 to 100 times less sample volume in comparison to other technologies
  • 0.12 uL per detergent (for triplicates)
  • No restrictions on buffer compositions

Travailler avec n’importe quel détergent, à toute concentration

  • Capillaires sans colmatage
  • Manipuler le lysat cellulaire sans problème
  • Quantifier l’agrégation
  • Sensibilité de détection de 50 nM (pour GFP)

Mesurer la taille absolue et la fluorescence

  • Haute résolution du rayon hydrodynamique (0,5 à 500 nm)
  • BRIC – Binding Related Intensity Change
  • Deux lectures orthogonales à partir d’un même jeu de données brutes fournissent une vision complète

Effectuer un contrôle qualité en amont – en une seule analyse

  • QC automatique avant l’analyse approfondie
  • Évaluation quantitative de l’agrégation
  • Fonctionnalité du site de liaison
  • L’indice de polydispersité permet d’évaluer l’uniformité de la solubilisation
  • La détection précoce améliore l’efficacité en éliminant les détergents sous-optimaux

Comment FIDA
accélère-t-il le criblage de détergentspour la solubilisation des protéines ?

Les utilisateurs de FIDA réduisent leur temps d’expérience de 85 %, économisant plusieurs jours. Comment ? Grâce à l’autosampler autonome de FIDA et à la possibilité d’identifier tôt les problèmes de stabilité, d’états oligomériques et de fonctionnalité des sites de liaison.

1.5 ul

singlets

<3h

Triplicates

Sample Volume

12 Detergents

Experimental Time

12 Detergents

Avantages

Maintient le lysat cellulaire à 5 °C en mode autonome
Détection quantitative de l’activation et de la liaison dans des constructions membranaires complexes
Consommation réduite d’échantillons
Accès rapide aux données
Contrôle qualité approfondi
Dépannage éclairé

Caractéristiques

Triple contrôle de température
Autosampler
Quantification des agrégats
Quantification des protéines membranaires solubilisées
Indice de polydispersité
Oligomérisation

Measures

Accurate determination of dilute phase concentration
Relative droplet size distributions
Kinetics of droplet formation and maturation into amyloid fibrils
Determination of binding affinity between the polypeptide undergoing LLPS and LLPS-modulating compounds

Cibler les défis courants de la recherche sur les protéines membranaires

Challenge
Expression et purification
Les utilisateurs de FIDA peuvent déterminer la concentration en solution des protéines membranaires. Cela leur permet d’optimiser les conditions de cristallisation et de suivre les processus d’expression et de purification.

Avec seulement 0,12 µL par détergent (en triplicat) et jusqu’à 40 nL d’échantillon non purifié pour la caractérisation, FIDA utilise 10 à 100 fois moins de volume que les autres technologies.
Stabilité et hétérogénéité conformationnelle
Le triple contrôle de température et la possibilité de travailler dans des matrices non purifiées permettent aux utilisateurs de mieux contrôler la stabilité des protéines membranaires.
Caractérisation fonctionnelle
Travailler dans des matrices brutes augmente l’applicabilité des résultats. De plus, l’indice de polydispersité garantit que l’hétérogénéité de l’échantillon est prise en compte.
Caractérisation structurelle
La mesure de taille fournie par FIDA permet de suivre les changements dus aux interactions avec d’autres protéines ou ligands. Ces informations servent ensuite à analyser la structure et la fonction des protéines membranaires d’intérêt.

FIDA est utilisé dans la préparation d’échantillons pour la cryo-EM et dans la sélection de clones de nanocorps. Les utilisateurs peuvent appliquer une seule technologie pour caractériser leurs protéines membranaires, cribler des détergents, produire des nanocorps pour immobiliser leurs protéines membranaires et préparer des échantillons pour la cryo-EM.
Développement pharmaceutique efficace
FIDA mesure le changement de taille du complexe protéine membranaire lors de la liaison d’un ligand, en faisant un outil optimal pour évaluer les interactions protéine-ligand. Ces informations permettent d’identifier des ligands potentiels pour la découverte de médicaments.

Learn more during an exploratory call with Fidabio team.

We are happy to answer all of your questions. Book an exploratory call to learn more about FIDA and the match between your personal needs and what we can deliver. The call is non-binding and free of any charges, so feel free to fill the form!

In comparison to SPR, it (FIDA) is a simple system that you can run without expertise. It does not require an experienced operator to run the system, due to its ease of use. A wide range of buffers can be used, meaning that optimization is kept to a minimum. The software generates an evaluation report of the quality parameters with just a click of a button. (...) We were able to confirm the performance by evaluating in-house compounds using the demo instrument on site.

Hiroshi Kamiyama, PhD
Eisai Co., Ltd. Tsukuba Research Laboratories

This methodology is very sensitive and useful for assessing binding in a quantitative manner using small amounts of auto-fluorescent proteins. Using this method, we can observe clear changes in apparent hydrodynamic radius (Rh) and in fluorescence signal of EYA1 as a function of increasing concentrations of peptides or of small molecules

Dana Farber Institute
CANCER INSTITUTE

''Fida  Instrument provides a ''ruler'' to measure the length of fibrils''

Stefan Rüdiger Ph.D.
Professor of Protein Chemistry of Disease; Head of Department of Chemistry

''The FIDA is very effective for screening small molecules for solubility and interactions with protein targets. A major advantage has been its ability to clearly show drug binding to difficult-to-work-with targets such as intrinsically disordered proteins and amyloids''

Dr. Alexander Taylor
Research Fellow in Biochemistry/Biophysics

I would say that this instrument is quite useful for core facilities at KI or for Swedish research community in general:

  1. it was possible to measure unlabeled membrane proteins and soluble proteins at low concentrations in small volumes very fast (~6 minutes per measurement).
  2. I also like the temperature control and the autosampler which allowed us to run a lot of samples overnight.
  3. I would say that there is a lot of potential to perform other assays as well, such as the Kd determinations etc. (For this, I use ITC which is quite time-consuming and requires a lot of protein).
  4. In addition, the software and user interface for sample runs and data analysis is quite straightforward and intuitive to use.
Postdoctoral Researcher

"What we value about FIDA is the amount of information we can get from a tiny amount of protein in a single QC run. FIDA technology enables us to understand our proteins better - particularly when they behave in unexpected ways. We chose FIDA because it gives us that vital first result quickly - we don't waste our time optimising an assay that isn't going to work."

Duncan Smith
Lead Scientist

"I am convinced. I have never before been able to detect the ternary construct formation of my construct directly in cell lysate – it took less than two hours."

Thomas Smith
Associate Director, Chemical Biology & Therapeutics

"The Fida 1’s unique capability for measuring binding Kd from weak mM level to strong pM level really enhances our bioanalytical capabilities."

Sherry Zhu
Senior Scientist

"FIDA is an in-solution technique, and thus an ideal binding assay for structurally diverse bsAbs because the analysis does not rely on potentially obstructive surface immobilization and hence it is able to perform characterizations that are unbiased by bsAb format and spatial orientation of the binding domains."

Andreas V. Madsen
PhD Student

"After thorough comparisons, it was clear that the Fida 1, amongst others, presents unique opportunities in analysis of membrane proteins, which is essential to us."

Svend Kjær
Deputy Head of the Structural Biology Science Technology Platform

''The Fida 1 system offers a new approach to detergent screening that has significant advantages allowing essential data to be obtained faster using less material (…) this work presents a new approach to characterize membrane proteins that allows users to reducing costs and time as well as to analyze protein expressed at low levels in a short time thus overcoming any stability issues.''

Isabel Moraes
Principal Research Scientist

"I like the ease of use and the straightforward data analysis and, that experiments can be performed in any type of buffers. We get data, where no other biophysical methods worked before."

Cathrine Birck
Head of Integrated Structural Biology Platform

"The method is easy to setup in any standard laboratory and can be adopted for a high throughput (HTTP) screening, which enabled mechanistic studies of RNA nuclease interactions, as well as efficient guide RNA lead discovery (…) Fida 1 offers straightforward assay development, walk away automation, absolute measurement and ultra low sample consumption."

Denny Truong
Principal Research Associate

"FIDA provides in-depth assessment of activity combined with local and global protein structural changes by measuring the overall hydrodynamic radius of the protein with minimal sample consumption. In addition, it is possible to measure the affinity constant for the analyzed interaction."

Dr. Melanie Hug
Research Associate

"The beauty of Fida 1 is that it allows us to conduct a lot of biophysical measurements in one system using a small amount of reagent and a rapid read-out time which is important for our projects and to our customers. (…) Providing a high-quality, protein characterisation QC package is certainly extending and future proofing our capabilities in biophysical characterisation of the proteins we produce."

Mark Abbott
Managing Director

"The Fida 1 has allowed us to assess the performance of MIPs with a much higher throughput than was previously possible on other platforms. MIPs can be developed in as little as 8 weeks, which is a significant improvement on antibodies, and now they can be fully characterized at an accelerated pace too."

Alan Thomson
CEO

"Fida 1 can be used for full characterization of ternary complex formation for targeted protein degradation. The Fida 1 platform only consumes 39 nL of sample for one measurement and thus allows elaborate condition screening using very small amounts of sample material."

Roman Agafonov
Associate Director of Biochemistry, Biophysics & Structural Biology

"The Fida1 is a very user-friendly system. With the Fida software we can quickly design new methods, set up experiments, and analyze data. By far this is a great instrument and technology that has allowed us to run binding assays for LNP in solution and with flexibility to run in any complex media which we were unable to do using traditional binding methods that required ligand immobilization. The FidaBio customer service is amazing, they are very knowledgeable and responsive whenever I run into issues and need assistance. I highly recommend this instrument for LNP or any other nanoparticle characterization. The system and technology are versatile with applications beyond nanoparticles and is a must in the biophysical tool kit."

Biophysical Analytical Department
Senior Scientist, Analytical Development

"Eventually, with FIDA, we managed to characterise our LNPs. And it was done in less than 2 days. We had for a long time been struggling with SPR."

Chemical Biology and Therapeutics
Associate Director

"We had been looking for ways of quantifying our exosomes, and tested many platform, without success. In less than 2 days FIDA had developed an assay and shown trustworthy quantifications directly in fermentation broth"

Rane Harrison
Director, Analytical Development